מטרת המחקר הייתה לזהות גנים ומסלולים מרכזיים בפוטנציה, באמצעות שימוש בביו-אינפורמטיקה. החוקרים כיוונו לזהות את המנגנונים עשר עשויים להיות משותפים לאנדומטריוזיס (EMS) וסרטן שחלות (OC).
עוד בעניין דומה
החוקרים אספו שני קבצים של נתונים מתוך מאגר ה-Gene Expression Omnibus וה-limma package סייעה בזיהוי גנים נפוצים (DEGs) ב-EMS ו-OC בהשוואה לקבוצת ביקורת. החוקרים השתמשו בכלים ביו-אינפורמנטים שונים כדי לזהות מנגנונים הקשורים ל-DEGs. לאחר ביצוע אנליזה החוקרים יצרו רשת אינטראקציית חלבון-חלבון (PPI) וחישבו באמצעות כלים ביו-אינפורמטים את מידת הקישור של חלבונים שונים ברשת ה-PPI.
תוצאות המחקר הראו כי סך הכל 571 DEG חופפים זוהו בין EMS ל-OC (לעומת קבוצת ביקורת). DEGs מועשרים היו קשורים ל-36 מונחים גנטיים אונטולוגיים ושבעה מנגנונים גנומיים, אשר עבדו סביב ניטרול של מסלול איתות p53. באמצעות קפלן-מאייר אישרו החוקרים את הביטוי של הגנים שזוהו וקבעו כי ייתכן ו-CCNB1, CCNB2, BUB1B,י CCNA2, KIF2C, ו-TOP2A היו קשורים לירידה בשרידות ובשרידות ללא מחלה במקרים של OC.
החוקרים סיכמו כי המנגנונים העיקריים שזוהו הצביעו על דרך אפשרית בה EMS מתפתח ל-OC. כמו כן, החוקרים זיהו גנים אפשריים לניבוי הופעת OC ופרוגנוזה.
מקור:
yi Ni et. al (2021) Archives of Gynecology and Obstetrics DOI: 10.1007/s00404-021-06285-3
הירשמו לקבלת עדכונים בנושאים שעלו בכתבה
