ה-ESMO Precision Medicine Working Group התכנסה מחדש כדי לעדכן את ההמלצות משנת 2018/19 בנוגע למעקב אחר וריאנטים משוערים של שורות נבט (putative germline variants) שזוהו בעקבות ריצוף מרקמת הגידול (Tumour-only sequencing). ממצאי החוקרים פורסמו בכתב העת 'Annals of Oncology', והתבססו על אנליזה של 17,152 סוגי סרטן.
עוד בעניין דומה
החוקרים ערכו אנליזה על מערך נתונים מורחב, הכולל 49,264 דגימות מזווגות של גידול ודגימה תקינה. החוקרים הפעילו סינון ל-tumour detected variants על סמך תדירות האלל הווריאנטי (VAF: variant allele frequency), הפתוגניות החזויה, ותדירות הווריאציות באוכלוסייה. לאחר מכן, החוקרים בדקו את שיעור ה-tumour-detected variants המסוננים ממקור נבט אמיתי (שיעור ההמרה של קו הנבט (GCR: germline conversion rate)) ב- 58 גנים של רגישות לסרטן. כמו כן, החוקרים ערכו תתי-אנליזות המבוססות על גיל אבחון הסרטן, סוג הגידול הספציפי, וסטטוס ה- “on-tumour” (קשר מוכח בין הגן לסרטן).
מתוצאות המחקר עולה כי אנליזה של 45,472 דגימות גידול ממאיר סולידי וללא היפרמוטציה הניבה 21,351 tumour-detected variants, כאשר 3,515 מתוכם ממקור נבט אמיתי. 3.1% מהווריאנטים הפתוגניים האמיתיים של קו הנבט נעדרו מה-tumour-detected variants המסוננים. בגנים כגון BRCA1,יBRCA2 ו-PALB2, ה-GCR ב-tumour-detected variants המסוננים היה מעל 80%; לעומת זאת, ב-TP53,יAPC ו-STK11 GCR השיעור היה <2%.
לסיכום, אנליזה אסטרטגית ממוקדת קו נבט עשויה לתעדף תת-קבוצה של tumour-detected variants, כך שמעקב אחר קו הנבט יפיק את התשואה הגבוהה ביותר מבין הווריאנטים של קו נבט אמיתי ובר-פעולה.
כמו כן, החוקרים הציגו את ההמלצות המעודכנות בנוגע למעקב אחר קו נבט בעקבות ריצוף מרקמת הגידול. המלצות החוקרים כוללות: (i) עדכון ל-5% עבור ה-GCR המינימלי לכל גן, (ii) הכללה של ה-intermediate penetrance genes ברי-הפעולה ATM ו-CHEK2י(iii) הגדרת סט של שבעה גנים, ברי-הפעולה באופן המקסימלי, אשר מובילים לנטייה גנטית לסרטן (BRCA1, BRCA2, PALB2, MLH1, MSH2, MSH6, RET), ואחריהם מומלץ לבצע מעקב אחר קו הנבט, ללא קשר לסוג הגידול.
מקור:
הירשמו לקבלת עדכונים בנושאים שעלו בכתבה
